Všeobecné knižnice fragmentov
Všeobecné knižnice fragmentov sú základom pre objavovanie liečiv na báze fragmentov (FBDD - Fragment-Based Drug Discovery), čo je alternatíva k HTS. Tieto knižnice obsahujú malé molekuly (fragmenty, typicky <300 Da) s vysokou rozpustnosťou, ktoré sú optimalizované pre biofyzikálne metódy skríningu (napr. NMR, SPR, X-ray). Využívate prístup FBDD na nájdenie počiatočných väzobných bodov na vašom proteínovom cieli a potrebujete diverzifikovanú knižnicu fragmentov, ktorá spĺňa "Rule of Three"? Nájdite tu knižnicu s vysokou rozpustnosťou pre váš biofyzikálny skríning.
Radenie produktov
2 položiek celkom
Výpis produktov
Ovládacie prvky výpisu
2 položiek celkom
Všeobecné knižnice fragmentov (General Fragment Libraries) sú základným nástrojom pre inovatívny prístup k objavovaniu liečiv, známy ako Fragment-Based Drug Discovery (FBDD). Tento prístup je alternatívou ku klasickému HTS a v posledných rokoch viedol k objavu niekoľkých schválených liekov. Tieto knižnice sú podkategóriou knižníc fragmentov.
Princíp FBDD vs. HTS
Tradičný High-Throughput Screening (HTS) testuje veľké zlúčeniny podobné liekom (veľkosť 300-500 Da) a hľadá relatívne silné "hity" (väzba v mikro- až nanomolárnom rozsahu).
FBDD funguje inak:
- Skríning fragmentov: Všeobecné knižnice fragmentov obsahujú veľmi malé (veľkosť 150-300 Da), chemicky jednoduché molekuly ("fragmenty").
- Detekcia slabej väzby: Tieto fragmenty sa viažu na cieľový proteín len veľmi slabo (v milimolárnom rozsahu, mM).
- Optimalizácia: Po nájdení fragmentu sa tento fragment chemicky "pestuje" (growing) alebo "spája" (linking) s inými fragmentmi, aby sa postupne vybudovala nová, vysoko potentná a špecifická molekula (liečivo).
Kľúčové vlastnosti všeobecnej knižnice fragmentov
Aby bol FBDD skríning vôbec možný, musia fragmenty spĺňať prísne kritériá, známe ako "Pravidlo troch" (Rule of Three, Ro3):
- Molekulová hmotnosť (MW) < 300 Da
- Počet donorov H-väzby ≤ 3
- Počet akceptorov H-väzby ≤ 3
- cLogP (lipofilita) ≤ 3
Najdôležitejšou vlastnosťou je vysoká rozpustnosť vo vode. Keďže väzba je veľmi slabá, skríning sa musí vykonávať pri vysokých koncentráciách fragmentov. Na detekciu tejto slabej väzby sa nemôžu použiť bežné biochemické testy, ale musia sa použiť citlivé biofyzikálne metódy, ako je NMR spektroskopia, Surface Plasmon Resonance (SPR) alebo Röntgenová kryštalografia – a tie všetky vyžadujú vysoko rozpustné zlúčeniny.
Náš sortiment (TargetMol)
Naše všeobecné knižnice fragmentov (napr. od TargetMol) sú navrhnuté presne podľa týchto pravidiel. Ponúkajú diverzifikovaný súbor stoviek až tisícov fragmentov s vysokou rozpustnosťou a vynikajúcimi vlastnosťami, pripravené na okamžité použitie vo vašom biofyzikálnom skríningu. Pre špecifickejšie potreby sú k dispozícii aj charakteristické knižnice fragmentov.
