Knižnice fragmentov
Objavovanie liekov na báze fragmentov (FBDD) sa v poslednom desaťročí ukázalo ako alternatívny prístup k tradičnej identifikácii látok prostredníctvom vysoko výkonného skríningu (HTS). Na rozdiel od HTS sa pri FBDD identifikujú menšie zlúčeniny, "fragmenty", ktoré sa viažu na rôzne časti biologického cieľa. FBDD zohrala úlohu pri objavovaní 2 schválených liekov a najmenej 30 liekov, ktoré sú v rôznych štádiách klinického vývoja.
V reakcii na tento zjavný trend v objavovaní liečiv spoločnosť TargetMol navrhla svoje knižnice fragmentov.
Radenie produktov
10 položiek celkom
Výpis produktov
Ovládacie prvky výpisu
10 položiek celkom
Knižnice fragmentov (Fragment Libraries) sú špecializované knižnice zlúčenín určené pre alternatívny prístup k objavovaniu liečiv, známy ako Fragment-Based Drug Discovery (FBDD). Tento prístup sa v posledných rokoch ukázal ako mimoriadne úspešný a je alternatívou k tradičnému High-Throughput Screening (HTS).
Čo je objavovanie liečiv na báze fragmentov (FBDD)?
Tradičné HTS testuje státisíce veľkých zlúčenín podobných liekom a hľadá "hity" s relatívne silnou väzbou (v mikromolárnom rozsahu, µM). FBDD funguje opačne:
- Skríning malých molekúl: Knižnice fragmentov obsahujú veľmi malé (zvyčajne < 300 Da), chemicky jednoduché molekuly ("fragmenty").
- Hľadanie slabej väzby: Tieto fragmenty sa viažu na cieľový proteín len veľmi slabo (v milimolárnom až mikromolárnom rozsahu, mM-µM).
- Detekcia: Kvôli tejto slabej väzbe sa nedajú detegovať bežnými HTS testami. Na ich nájdenie sa musia použiť citlivé biofyzikálne metódy, ako je NMR spektroskopia, röntgenová kryštalografia alebo Surface Plasmon Resonance (SPR).
- Optimalizácia: Po nájdení viacerých fragmentov, ktoré sa viažu na rôzne miesta proteínu, ich chemici začnú "spájať" alebo "pestovať" (grow) a vytvárať tak novú, oveľa silnejšiu a vysoko špecifickú molekulu (liečivo).
Prečo používať FBDD namiesto HTS?
- Vyššia miera "hitov" (Hit Rate): Malé fragmenty dokážu efektívnejšie preskúmať väzobné miesta proteínu.
- Kvalitnejšie východiskové body: Fragmenty, ktoré sa nájdu, majú často veľmi dobrú "väzbovú efektivitu" (binding efficiency), čo z nich robí ideálny základ pre medikačnú chémiu.
- Prístup k ťažkým cieľom: FBDD sa ukázalo ako úspešné pri hľadaní inhibítorov pre ciele, ktoré boli predtým považované za "nedrogovateľné" (napr. interakcie proteín-proteín).
Náš sortiment knižníc fragmentov (TargetMol)
Naše knižnice fragmentov od TargetMol sú navrhnuté tak, aby spĺňali prísne kritériá pre FBDD, najmä tzv. "Pravidlo troch" (Rule of Three):
- Molekulová hmotnosť < 300 Da
- Vysoká rozpustnosť vo vode (kľúčové pre NMR)
- Špecifické farmakokinetické vlastnosti
Ponúkame všeobecné knižnice fragmentov pre počiatočný skríning, ako aj charakteristické knižnice zamerané napríklad na 3D štruktúry alebo špecifické farmakofóry.
