Charakteristické knižnice fragmentov
Charakteristické knižnice fragmentov sú cielené súbory malých molekúl, ktoré sa zameriavajú na špecifické chemické vlastnosti alebo štruktúrnu zložitosť. Pokrývame špecializované knižnice, ako sú tie s vysokou 3D diverzitou (viac sp3 centier), knižnice zamerané na farmakofóry, fragmenty obsahujúce špecifické skupiny (napr. karboxylové kyseliny) alebo fragmenty odvodené z už existujúcich liekov (drug-like fragments). Hľadáte fragmenty s väčšou trojrozmernou štruktúrou na zacielenie komplexnejších väzobných miest, alebo potrebujete knižnicu fragmentov s konkrétnou funkčnou skupinou pre kovalentné dokovanie? Nájdite tu špecializovanú knižnicu pre váš pokročilý FBDD program.
Radenie produktov
8 položiek celkom
Výpis produktov
Ovládacie prvky výpisu
8 položiek celkom
Charakteristické knižnice fragmentov (Characterized Fragment Libraries) sú pokročilou kategóriou knižníc fragmentov, ktoré idú nad rámec všeobecných knižníc. Zatiaľ čo všeobecné knižnice sú zamerané na širokú diverzitu a súlad s "Pravidlom troch", charakteristické knižnice sú menšie, cielené súbory fragmentov, ktoré sú zoskupené na základe špecifických chemických vlastností alebo štruktúr.
Prečo používať charakteristické knižnice fragmentov?
Tieto knižnice sú určené pre výskumníkov, ktorí pri skríningu (FBDD) hľadajú špecifické typy interakcií alebo sa snažia zacieliť na obzvlášť náročné väzobné miesta (napr. plytké povrchy), kde bežné fragmenty zlyhávajú.
Typy charakteristických knižníc (napr. TargetMol)
Portfólio týchto špecializovaných knižníc je rozmanité:
1. Knižnice 3D fragmentov (3D Diversity Fragments)
Mnoho všeobecných knižníc fragmentov je chemicky "plochých" (dominujú aromatické kruhy). 3D fragmenty sú naopak obohatené o sp3-hybridizované atómy, čo im dáva zložitejšiu trojrozmernú štruktúru. Tieto 3D tvary sú často lepšie prispôsobené na väzbu do komplexných alebo alosterických väzobných miest na proteínoch.
2. Knižnice farmakofórov (Pharmacophore Fragments)
Tieto knižnice nie sú diverzifikované, ale sú zamerané na opakovanie špecifických väzobných motívov (farmakofórov), o ktorých je známe, že sú dôležité pre väzbu na proteíny (napr. motívy schopné tvoriť vodíkové väzby, hydrofóbne interakcie atď.).
3. Knižnice fragmentov so špecifickými funkčnými skupinami
Sú to kolekcie, kde každý fragment obsahuje špecifickú chemickú skupinu, napr.:
- Knižnica karboxylových kyselín: Fragmenty obsahujúce -COOH skupinu, ideálne pre ciele, ktoré viažu kyslé ligandy.
- Knižnica kovalentných fragmentov (FragLite): Fragmenty obsahujúce mierne reaktívnu skupinu ("warhead"), ktorá je schopná vytvoriť trvalú (kovalentnú) väzbu s inhibovaným cieľom.
4. Knižnice liekových fragmentov (Drug-like Fragments)
Fragmenty, ktoré sú odvodené zo štruktúr už schválených liekov. Majú teda už preukázanú biologickú relevanciu.
Tieto pokročilé nástroje od TargetMol sú určené pre medikačných chemikov a štrukturálnych biológov na optimalizáciu a hľadanie nových východiskových bodov pre objavovanie liečiv.
